Fragen und Probleme » new balance 840

Ten slotte hebben we een reeks new balance 840 analyses uitgevoerd om de demografische geschiedenis van poema's te onderzoeken.We hebben neutraliteitstests uitgevoerd (Tajima's D, Fu & Li 'D * en F *, Fu's F's) met DnaSP, evenals een analyse van de verkeerde combinatie (Rogers en Harpending, 1992; Schneider and Excoffier, 1999) met Arlequin.

We gingen uit van een Yule-proces voor de boom en namen een niet-gecorreleerde lognormale ontspannende moleculaire klok op. Om beter new balance dames sneaker aan de verwachtingen van het Yule-proces te voldoen, hebben we slechts vijf divergente puma-haplotypen opgenomen, samen met de twee hier gegenereerde jaguarundi-sequenties. klok new balance 31 veronderstelden we dat poema's en jaguarundi's uiteenliepen tussen 3,16 en 6,01 MYA (95% HPD van de schatting gerapporteerd door Johnson et al. (2006) met behulp van een nucleaire supermatrix).

De tweede set Beast-analyses was bedoeld om de tijd van de meest recente gemeenschappelijke voorouder (t MRCA) van verschillende new balance 46 groepen monsters af te leiden, en om de demografische geschiedenis van poema's te reconstrueren door eerdere fluctuaties in populatiegrootte te schatten via de Bayesian Skyline Plot ( BSP) benadering (Drummond et al., 2005).

De BSP-analyses werden alleen uitgevoerd voor sets new balance 32 (i) en (ii), omdat hun grotere steekproefomvang robuustere demografische gevolgtrekkingen mogelijk maakte De MCMC-parameters waren hetzelfde als in de eerste set Beast-analyses.

Er werden matige tot hoge niveaus van haplotype-diversiteit waargenomen, terwijl de nucleotide-diversiteit vrij laag was (tabel 2).

Haplotype H01 wordt gevonden in centraal Zuid-Amerika (Paraguay, evenals de Braziliaanse staten MS, SP en MG), en verschilt met minstens zes mutatiestappen van de belangrijkste haplotypes in Noord- en Midden-Amerika. Toen de M. trumani-sequentie in de netwerk (Figuur 2B), werd de lengte van de sequentie-uitlijning teruggebracht tot 286 bp om overeen te komen met het segment dat beschikbaar is voor deze outgroup.